大蛇丸在回到木叶后，依旧保持着对知识的渴求与对力量的追求。
这段时间里，他一边进行着自己的研究，一边带着纲手的弟弟千手绳树进行修行。
绳树是初代火影的孙子，继承了强大的血脉，大蛇丸对这个弟子自然是十分关心和照顾。
他为绳树制定了严密的修行计划，教授他各种忍术和战斗技巧，力求将这个年轻的忍者培养成未来木叶的支柱。
大蛇丸自己则利用这个时期，继续研究生命的奥秘与忍术的极限。
他通过与宇智波影月的合作研究，深入探索了写轮眼与木遁的力量，并在实验室中取得了一些新的突破。
他的目标不仅仅是强大自己，更是试图通过实验，揭开忍界最深处的秘密。
在雨之国的某个隐秘的地方，自来也正带着弥彦、长门和小南三名战争孤儿过着简单的生活。
起初，自来也只是因为心中的愧疚而决定留下来照顾这三个孩子，打算等他们有了自保和生活的能力后，就回到木叶。
然而，在与弥彦三人的相处中，他渐渐发现，这三个孩子不仅仅是普通的战争孤儿，他们的内心藏着对和平的渴望与坚定的信念。
某天，自来也偶然间看到了长门的双眼，那是传说中的仙人之眼——轮回眼。
那一刻，自来也心中猛然一震。
他想起了多年前在妙木山修行时，大蛤蟆仙人给他的那个预言：“你将会收一位弟子，他将是为忍界带来和平之人，是救世主。”
当时的自来也虽然对这个预言半信半疑，但一直将其铭记在心。
而如今，当他看到长门的轮回眼时，心中无比激动，仿佛命运的齿轮终于在这一刻开始转动。
自来也内心的疑虑渐渐散去，他确信自己已经找到了那个预言中的救世主——长门。
为了培养这位可能会为忍界带来和平的弟子，自来也决定将弥彦、长门和小南三人全都收为徒弟，亲自教授他们忍术。
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